Экспозиция делится на несколько тематических коллекций.

Палеонтология. В первом зале можно найти окаменелости морских животных мелового и юрского периодов, отпечатки древнейших растений и моллюсков. Из наиболее ценных экспонатов — череп пещерного медведя, которых обитал в абхазских землях еще 12 тысяч лет назад.

Этнография.  Данная экспозиция повествует о культурных особенностях абхазов, их быте и истории заселения Абхазии. Здесь же выставлена информация о знаменитых абхазах.

В центре зала расположилась лодка, воссозданной по старинным чертежам.

Рядом с ней макет традиционной абхазской усадьбы: жилой дом, двор с хозяйственными постройками. Хорошо сохранился старинный деревянный пресс для производства вина.

Каменный век и эпоха бронзы. На стендах демонстрируются археологические находки: каменные орудия, первая керамика, украшения. Имеется экспонат погребальной культуре, похоронный каменный ящик, найденный в селении Анхуа.

Так же имеется зал античного периода и периода Византии.  К X веку Абхазское царство было одним из самых влиятельных в Закавказье. У них были установившиеся торговые связи с Византией, что подтверждают находки монет с изображением византийских царей.